The koraljni grebeni oni su ekosustavi vrlo osjetljivi na promjene u okolišu. Varijacije u slanosti, koncentraciji zagađivača ili porastu temperatura mogu utjecati na koraljnu zajednicu. Klimatske promjene Utječe na koraljne grebene zbog porasta prosječne temperature vode za dva stupnja u području gdje se nalaze.
Preostali koralji prijete da nestanu ako ti uvjeti nastave postojati. Koralj se nalazi u blizini otoka Ishigaki u arhipelagu Okinawa i proglašen je rezervatom prirode. Ima više od 70 vrsta koralja a smatra se jednim od najstarijih i najvećih grebena na cijeloj sjevernoj hemisferi.
Koraljni grebeni izbjeljuju se kada uvjeti okoliša nisu povoljni i umiru. 97% koralja koji čine ovaj greben izbijeljeni su i 56% ih je umrlo. Kako se prosječne temperature vode povećavaju zbog klimatskih promjena i globalnog zatopljenja, koraljni se greben ne može prilagoditi takvim promjenama i umrijeti. S koraljima umire i sva fauna s njima povezana, a to ovisi o tome da koralji žive.
Ono zbog čega je temperatura okolnih voda porasla za dva stupnja je meteorološki fenomen poznat kao Dječak. El Niño povećava temperature površinskih voda mora i pridonio je izbjeljivanju koralja. Izbjeljivanje se također događa kada su koralji suočeni s ekstremnim promjenama u hranjivim tvarima i svjetlosti.
Činjenica da koralji počinju umirati dovodi u opasnost obilje vrsta riba koje ovise o grebenima zbog svoje hrane i skrovišta. Ako se emisije stakleničkih plinova nastave brzinom kojom su danas, zalihe ribe mogle bi se smanjiti između 10 i 30% do 2050. godine prema podacima IUCN-a.