לעתים קרובות חשוב לציין את הרמה בה נמצאים חלקים מסוימים בענן. כדי לציין רמה כזו, ניתן להשתמש בשני מושגים, של גובה וזה של גובה.
גובהה של נקודה (לדוגמא: בסיס ענן) הוא המרחק האנכי בין מפלס אתר התצפית לגובה אותה נקודה. יש לציין כי ניתן למצוא את נקודת התצפית על גבעה להר. במקום זאת, גובה הנקודה הוא המרחק האנכי בין מפלס הים הממוצע לגובה הנקודה. משקיפים על פני השטח משתמשים בדרך כלל במושג הגובה. משקיפים מטוסים, לעומת זאת, מתייחסים בדרך כלל לגובה. ה ממד אנכי של ענן הוא המרחק האנכי בין רמת הבסיס לזה של החלק העליון שלו.
עננים ממוקמים בדרך כלל בגבהים בין מפלס הים לרמת הטרופופוזה. רמת ה טרופופאוזה הוא משתנה במרחב ובזמן; לכן, צמרות העננים גבוהות יותר באזורים הטרופיים מאשר בקו רוחב בינוני וגבוה. אנו זוכרים כי הטרופופאוזה היה הגבול בין הטרופוספירה לסטרטוספירה.
על פי ההסכמה, החלק של האטמוספרה שבו מופיעים עננים בדרך כלל חולק לשלוש רמות הנקראות, בהתאמה, גבוה, בינוני ונמוך. כל קומה מוגדרת על ידי מערך הרמות בו עננים מז'אנרים מסוימים מתרחשים בתדירות הגבוהה ביותר. הרצפות חופפות מעט וגבולותיהן משתנים עם הגובה.
כדוגמה, ב איזורי הקטבים הרמה הגבוהה היא בין 3 ל -8 ק"מ ואילו באזורים המשווניים רמה זו היא בין 6 ל -18 ק"מ.